1、办理机关不同。起诉离婚是通过法院处理办理离婚，协议离婚是婚姻登记机关办理。
2、发生的原因不同。协议离婚的前提是必须要双方达成一致。起诉离婚主要是没有达成一致意见。
3、是否需要双方到场不同。起诉离婚，在被告不到场的情况下依然可以缺席判决，协议离婚必须双方亲自到场。法律依据：《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。