1、犯变造企业债券罪的，一般应处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处1-10万元的罚金；
2、变造企业债券的数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处2-20万元的罚金；
3、如果单位犯本罪的，应对单位处罚金，并对其直接责任人员依照个人犯罪的规定处罚。法律依据：《刑法》第一百七十八条
伪造、变造股票或者公司、企业债券，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。
单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。