仲裁机构是否能够确认无争议合同的效力

能。依据我国相关法律的规定，仲裁庭有权确认合同的效力，所以，仲裁是可以确认无争议合同的效力的，并且仲裁协议是独立存在的，合同就更不影响仲裁协议的效力。
《中华人民共和国仲裁法》第十九条